大内库藏武功秘笈《葵花宝典》失窃。东厂主管太监古今福（刘洵饰）率千户欧阳全（张学友饰）等，南下调查辞官锦衣卫林镇南，同时收用“五岳盟主”左冷禅（元华饰）外围策应。华山派大弟子令狐冲（许冠杰饰）与师妹岳灵珊（叶童饰）奉师命增援林镇南，无奈两人实力不济，领得林镇南遗嘱后遁走，二人于路先后巧遇顺风堂堂主刘正风（午马饰）、日月神教长老曲洋（林正英饰）、华山派风清扬，获传《笑傲江湖》曲谱和独孤九剑。
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